Verso sud, alle spalle delle località balneari, il visitatore incontra Comacchio, singolare insediamento lagunare costruito in epoca tardo romana su tredici piccole isole, celebre per i suoi canali e i caratteristici monumenti, tra cui campeggiano su tutti il ponte dei Trepponti e la Manifattura dei Marinati.
Attraverso il Ponte di San Pietro e l'argine di Valle Fattibello si raggiunge il Centro visite delle Valli, Stazione Foce. Da qui partono diversi itinerari di grande suggestione a piedi, in bicicletta o in motonave alla scoperta degli antichi casoni di valle, dove un tempo vivevano i pescatori.
Collegata alle valli, si trova la Salina, con il suo alternarsi di canali, dossi, vasche per la raccolta del prezioso oro bianco, e dove vivono indisturbati bellissimi esemplari di uccelli, tra cui i fenicotteri rosa.
Una bella panoramica sulle Valli di Comacchio si può avere anche percorrendo il margine occidentale del sistema vallivo fino a raggiungere l'argine del fiume Reno a sud, da cui si gode la vista della lunga penisola di Boscoforte, dove sostano fra gli altri fenicotteri, avocette e cavalieri d’Italia.
Per informazioni su escursioni in barca nelle valli e alla salina, a piedi e in bicicletta: Servizi turistici valli e saline di Comacchio tel. 340 2534267 e Centro visita del Parco del Delta del Po, Manifattura dei Marinati, tel. 0533 81742, mail manifatturadeimarinati@parcodeltapo.it. Per info turistiche: Ufficio Informazioni Turistiche di Comacchio, tel. 0533 314154, mail Comacchio.iat@comune.comacchio.fe.it.
